Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2CP19387 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms