Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XBP1P17861 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XBP1P17861 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XBP1P17861 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XBP1P17861 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XBP1P17861 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XBP1P17861 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XBP1P17861 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms