Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DESP17661 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DESP17661 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DESP17661 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms