Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTHFD1P11586 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTHFD1P11586 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms