Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RARBP10826 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RARBP10826 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RARBP10826 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARBP10826 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARBP10826 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARBP10826 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARBP10826 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RARBP10826 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms