Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHGAP10645 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHGAP10645 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms