Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms