Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKAP2O75563 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms