Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
N4BP1O75113 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms