Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSVO60911 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSVO60911 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms