Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF2O60811 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms