Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms