Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD1O60671 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD1O60671 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD1O60671 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD1O60671 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD1O60671 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD1O60671 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD1O60671 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD1O60671 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD1O60671 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms