Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL3O43909 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL3O43909 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms