Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB3O43889 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms