Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYNGR2O43760 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393 ms