Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MTSS1O43312 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms