Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC7A4O43246 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 408.3 ms