Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBDO15205 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBDO15205 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBDO15205 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms