Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNMO15061 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms