Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms