Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms