Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SRRM5B3KS81 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SRRM5B3KS81 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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