Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1571.6 ms