Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
V9GY48 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
V9GY48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
V9GY48 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
V9GY48 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
V9GY48 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
V9GY48 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
V9GY48 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
V9GY48 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
V9GY48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
V9GY48 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
V9GY48 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
V9GY48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
V9GY48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
V9GY48 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
V9GY48 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
V9GY48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
V9GY48 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
V9GY48 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
V9GY48 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
V9GY48 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
V9GY48 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
V9GY48 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
V9GY48 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
V9GY48 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
V9GY48 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
V9GY48 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
V9GY48 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
V9GY48 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
V9GY48 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
V9GY48 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
V9GY48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
V9GY48 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
V9GY48 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
V9GY48 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms