Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD54BQ9Y620 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms