Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX8Q9Y5X2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms