Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX10Q9Y5X0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX10Q9Y5X0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms