Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3AQ9Y2J0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPH3AQ9Y2J0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms