Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP2BQ9UQN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP2BQ9UQN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms