Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHANK2Q9UPX8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHANK2Q9UPX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms