Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4E1Q9UPM8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP4E1Q9UPM8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP4E1Q9UPM8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP4E1Q9UPM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP4E1Q9UPM8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP4E1Q9UPM8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms