Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA4Q9UN74 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA4Q9UN74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA4Q9UN74 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms