Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4EQ9ULY5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4EQ9ULY5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4EQ9ULY5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4EQ9ULY5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLEC4EQ9ULY5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLEC4EQ9ULY5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms