Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCPG1Q9ULG6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCPG1Q9ULG6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCPG1Q9ULG6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms