Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PADI1Q9ULC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI1Q9ULC6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms