Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CFAP45Q9UL16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP45Q9UL16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP45Q9UL16 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms