Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM8Q9UJA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms