Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO3A1Q9UIG8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO3A1Q9UIG8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms