Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTNAP2Q9UHC6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP2Q9UHC6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP2Q9UHC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms