Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL3Q9UH77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms