Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEPT3Q9UH03 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEPT3Q9UH03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEPT3Q9UH03 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms