Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCD2Q9UBJ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD2Q9UBJ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms