Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XCL2Q9UBD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms