Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms