Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL9Q9P2J3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL9Q9P2J3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms