Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL20A1Q9P218 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL20A1Q9P218 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL20A1Q9P218 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms