Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SACSQ9NZJ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SACSQ9NZJ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms