Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM9Q9NXL9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM9Q9NXL9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM9Q9NXL9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms