Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK13-1Q9NX77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK13-1Q9NX77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms